湖汐说：潮汐对于海洋生物的生理过程和生活习性有巨大的影响。因为海水中的化学成份（如含盐量）以及压力、光线等海洋物理的条件。都与潮汐的变化有直接关系。生活在潮间带和潮下浅海中的现代的和化石的瓣鳃类，随着一天两次的涨潮而在贝壳表面上留下了生长层。因为潮汐是受月亮影响的，因此，在珊瑚以及其它化石上留下的每日的条纹，与月亮的潮汐有直接关系。

　　食物供给变化说：每一种动物，每隔一段时间，就都会由于饥饿而去寻找食物。动物的进食有周期性。有人作过现代珊瑚的实验，证明现代珊瑚也是定时叽饿，定时进食的，推测古代珊瑚亦应如此。因此，有的科学家提出：代表珊瑚每天生长的“环脊”（珊瑚化石表壁上比较纤细的条纹）的形成与珊瑚每天进食有直接关系。

　　生育周期说：不论古代或现代珊瑚．都是每一个朔望月繁殖一次，在繁殖期间，珊瑚的全部活动在于生育幼体，于是正常的新陈代谢作用受到了阻碍，这时候骨骼上的碳酸钙的沉积量急剧地减少，直径收缩，在外观上，出现了环沟状的构造。生物期过后，又恢复了正常。这就是珊瑚出现月增长标志的原因。

　　内生论与外生论：内生论者认为，某些生物体从遗传上就带有一种像钟一样的而且能够周而复始的循环周期，不受外界的影响（如生物周期说）。外生沦则坚持生物所以能够像上好了弦的钟表，本要原因是为了外来的有节律的刺激信号（如潮汐说，食物供给说）。他们认为：地球的自转，昼夜的交替以及日光、温度、空气、宇宙线、电磁场、引力、太阳黑子等。都是生物钟的演奏者。

　　古生物钟究竟是如何形成的，科学家仍在积极地探索。